綜合考慮，李純決定按照立長立賢的原則，在夏原遷都后不久，也就是元和十一年三月，正式冊封長子李寧為太子。為了鍛煉李寧，李純有意讓他參加處理一些政務，還派人帶他到一些地方游歷，增長見識。
李寧的表現還不錯，在大臣面前相對謙虛，從來不擺架子，做事認真，有點像儲君的樣子。可能是因為有些隱疾的原因，李寧的身體不太好，李純對此有些擔心。
元和十二年十二月，洛陽到夏原的鐵路在熱火朝天的建設，李純就想到夏原城北的施工現場視察一下，想著帶上太子李寧，一起去查看一下鐵路進展情況。宮人突然報告說，太子李寧病重，李純趕緊起駕向東宮趕去。
到了東宮，只見太子處于昏迷狀態，有兩三個太醫在守著，太子的母親紀妃也趕來了，坐在那里哭哭啼啼。
李純趕忙詢問情況，太醫報告說，太子的心臟有些問題，可能有梗塞的情況，目前脈搏微弱，生命垂危，形勢很不好。李純感覺像天塌了一樣，急忙下令太醫們想盡一切辦法，搶救太子的性命。
幾個太醫嘗試了各種辦法，又是喂藥，又是按壓，忙到晚上，還是回天乏力，太子李寧最終失去了氣息，宣告死亡。
紀妃哭的死去活來，李純也是悲傷不已，自己最看好的長子，居然就這樣突然走了。自己開創的大唐盛世，還需要人去繼承發揚，一個孩子剛成年不久，正是干事業的黃金年齡，沒有任何預兆就撒手人寰。
李純宣布罷朝三日，命令禮事部給太子辦了隆重的葬禮，葬完李寧后，李純心情頹廢，度過了一個壓抑的春節。
到了元和十三年春，李純仍然興致不高，本想把政務委托給李吉甫，自己清閑一段時間。沒想到崔群來報，李吉甫病了，病的還挺厲害，無法上朝，請求皇帝讓別人代理左丞一職。
李純有點蒙圈了，怎么霉運連連，身邊人接連遭難，趕忙到李吉甫的府上探視。
李純剛即位的時候，李吉甫正好從地方州刺史的崗位入朝為官，在任上非常勤勉能干，做事細致認真，各種數據、資料熟記于心，還專門編著了《元和郡縣圖志》，此書成為李純為了解唐朝情況的重要典籍，也為朝廷施政提供了依據。
在李純心中，李吉甫超越所有的大臣排在第一位，自他擔任左丞以來，協助李純辦了不少大事，他對很多事情的看法甚至和李純心意相通，君臣之間配合的非常好。
很多事，李純只是交代了一下，李吉甫就會帶人認真的籌劃和執行，結果總能讓人滿意。
身為宰相，李吉甫沒有多少架子，和同僚關系處理的不錯，好幾次大的機構和人事變動，李吉甫都去做了不少工作，保證了改革的順利進行。
可以說，李吉甫是李純的重要助手，發揮了不可替代的作用，李純甚至對他有了一些依賴感，很多事直接交給他處理。
李純到了李吉甫的府上，看到李吉甫躺在床上，氣色差了很多，一臉病容。看到李純來了，李吉甫還要勉強起來行禮，李純趕忙將他按下，示意他躺好。
李純道：“吉甫為了國事操勞辛苦了，身體要緊，先靜心養病，安心歇息一段，等病好了再回朝廷。”
李吉甫說：“臣的老毛病，臣很清楚，這次病的厲害，恐怕難以繼續為朝廷效力了，還請皇上早點物色合適的人選接替臣。”
李純道：“眾臣之中，唯有你的能力最強，最合朕意，沒有誰能代替你，朕還需要你幫助朝廷開創更好的盛世。”
李吉甫說：“皇上謬贊了，能跟著皇上干事業，是臣的榮幸，看著大唐在皇上的帶領下，一天天強大，臣也能出一些力，臣感到特別榮幸。”
李純道：“這些年你也付出很多，不少具體事都是都是你帶著其他人在做，你在后面默默做了很多貢獻，朕都清楚。其實朕還有很多設想，想跟你商議，想和你一起做更多事，把大唐建成亙古未有的強大王朝。”
李吉甫說：“陛下的奇思妙想太多，格局很大，氣魄也大，采取很多有效措施，用了十二年，就讓大唐重現盛世，文治武功甚至超過太宗皇帝。不知陛下所說的亙古未有的強大王朝，是什么樣子，臣是恐怕沒有機會看到了，但是很想聽聽。”
李純道：“這個世界很大，但是有邊界的，朕準備把大唐以外所有的疆域都拿下來，建立一個由華人統治的超級王朝，華人成為領導民族，都都能過上有地位、有榮耀的好日子，但是實施起來要很久，朕都怕自己中間也生病倒下，無法實現。”
李吉甫說：“自有華夏以來，漢人過上好日子的階段屈指可數，大部分時間不是動亂就是衰落，我們大唐也只有貞觀和開元年間，漢人揚眉吐氣過了一些好日子，天寶年間安史之亂以后，我們大唐就衰落了，臣也盼著漢人能過上陛下所描述的好日子。”
李純道：“華夏民族，是世界上人數最多，也是最聰明、最勤奮的民族，只要能夠聚集力量發展，一致對外，強大起來本沒那么難。最大的教訓是內斗太多，多次讓異族鉆了空子，還有一些帝王荒淫無度，大臣貪污腐敗，把好好的國家給敗壞了。”
李吉甫說：“陛下說的很對，一個國家，帝王和大臣的作用很重要，臣觀陛下，睿智敏達、操勞國事，勤儉律己，給我們臣子做了很好的表率，連臣有時都要稍微享受一下，陛下對自己要求太高了。”
李純道：“老子說，勤以修身，儉以養德，為了實現那個宏大的目標，朕總感覺有很多事要做，有太多需要改革推進的事項，需要不斷的思考，不停的出新措施。生活方面，稍微享受一些，也不會有任何問題，但是朕怕的是抵不住人性的弱點，會像當年玄宗皇帝那樣，被享受腐蝕了意志，前明后暗，斷送了大唐發展的路徑。高處不勝寒，朕的一舉一動都會影響天下人的看法，如果朕自己都在享受，還有什么底氣要求子民們艱苦奮斗，反腐更是一句空談。”
李吉甫說：“一直以來我都沒有深刻理解陛下的苦心，今天算是真的感受到了，反腐搞了那么多年都沒法解決，陛下有信心嗎？”
李純道：“說句實在話，朕有大的決心，但是也沒有十足的把握，畢竟腐敗深藏于人性的弱點之中，要根除很難。所以朕也只是一點一點的在作努力，估計要達到理想效果起碼還要二十年。”
李吉甫說：“怎么要用那么久，陛下以身作則，再把措施搞得嚴格些，懲罰搞得狠一些，必能有更好的效果。”
李純道：“朕以身作則沒問題，采取嚴厲的措施也是可以起到一定的效果。但是臣子們要過上更好的生活的想法沒有錯，不讓他們腐敗，首先要讓他們取得足夠的合法收入，然后再采取一些周密而嚴厲的手段，才會起到疏堵結合的好效果。說白了，朕想先讓臣子們過上好生活，才有底氣去狠心徹底反腐，朕不希望靠著高壓手段，讓臣子們為了保持廉潔，而讓他和家人們過苦日子。臣子是國家發展的具體實施者，理應享受發展的紅利，首先讓他們過上豐衣足食、體面大方的生活，他們才沒有理由去腐敗，并從內心上愿意接受監督，認同對腐敗官員的懲治，反腐的前提才算成立。”
李吉甫說：“陛下想的更遠，首先還是為了我們臣子著想，關心關愛著每個臣子，要讓官員們都過上豐衣足食、體面大方的生活，高級官員沒問題，中低級官員還有難度。國家雖然發展了，也富了一批人，但是還是窮人占多數，朝廷需要開支的地方很多，目前還難以讓所有官員都實現富足體面。”
李純道：“朕沒有完美主義情結，目前只要把腐敗控制在一個有限的范圍內就好，對那些明目張膽、情節惡劣的官員，朕也不會手軟，但是各項事業要協調推進，目前的當務之急是把經濟、科技、軍事先發展起來，后面再把其他事項一步步完善。”
李吉甫說：“陛下的想法很周全，每個階段都有側重點，穩扎穩打，可惜臣沒有時間繼續輔佐陛下實現這些偉大愿景，陛下還是早點選擇臣的接替人選吧。”
說了不少話，李純也看到李吉甫非常疲憊了，估計他的病情真的可能難以好轉，就問到：“你的左丞位置很重要，你可有合適的人推薦？”
李吉甫說：“左丞是百官之首，臣退下來，自然是應該右丞武元衡接任，武元衡能力出眾，辦事果斷，立下大功，他做左丞是眾望所歸。”
李純道：“武元衡能力不錯，剛毅果決，但是有些偏激，做事的細致性不夠，要有一個細致認真的右丞跟他搭班子。”
李吉甫說：“說到細致認真，樞密使崔群最為合適，他一直在陛下身邊做事，陛下對他也很了解，是一個能干事、會辦事的人才。”
李純道：“經你這么一說，朕也覺得崔群合適，看時候不早了，你還有沒有其他需要跟朕說的。”
李吉甫說：“臣的病情可能會越來越重，怕是和陛下說話的機會不多了，臣別的都沒啥想法，唯一牽掛的就是次子李德裕，這個孩子有點才華，也有想法有干勁，是我們李家未來的希望，還希望陛下以后能給他機會鍛煉發展一下。”
李純道：“為人父母，為子女考慮，無可厚非，朕后面會關注他，會給他展示才能的機會。朕很珍惜有你輔佐的這十二年，我們君臣一場是人生重要的緣分，朕今天和你說了不少知心話，先到這里吧，你先在家中靜養，爭取把病治好。”
李吉甫也感覺很疲憊，就勉強拱手送李純離去。
回宮后，想著李吉甫憔悴的樣子，李純也感到他的病情難以好轉，就考慮后續的安排。
對于李吉甫，要有個說法，操勞了這么多年，朝廷必須要表示一下，可以封他為從一品的司空，以體面的方式退下來。
李純按照李吉甫的建議，由武元衡任左丞，升崔群為右丞。樞密使的人選，李純覺得李藩穩重練達、辦事可靠，可以接任，至于李藩空缺的光祿大夫，可以先放著，后面再考慮。
考慮停當以后，李純派李承閩到中書省傳達旨意，由中書省草擬圣旨，蓋印后次日下達。中書省一下子升遷三個人，當然是對草擬這個圣旨很積極、很用心，用了不少褒獎之詞。
為了彰顯朝廷的恩德，李純還賞賜了李吉甫一棟別墅，名為平泉別墅，讓李吉甫養病養老。看到李純如此關愛自己，李吉甫激動不已，能夠位極人臣，又得明主賞識，這一輩子值了。
看到好友兼搭檔李吉甫生病，武元衡過去探望了兩次，看到李吉甫的病情確實難以好轉，只能為他嘆息。接過左丞的職務，成了百官之首，武元衡感覺身上的擔子更重了，但是也符合他干一番大事業的夙愿，當仁不讓、勁頭十足的干起來。
一直以來，崔群都是干著皇帝秘書長的活，早已適應了這個角色，沒想到能夠來個大跨越，直接晉升為右丞。雖說這種晉升也符合朝廷的規矩，但是從正三品晉升從二品都很難，一下子晉升為二品，成為朝廷的中樞要員，也是朝廷莫大的恩德。
崔群知道李純看重自己，但是能讓李純看好的重臣還有好幾個，自己能夠脫穎而出，一定是李吉甫的推薦。
長期以來，崔群和李吉甫的關系不錯，既是同僚，也是朋友，借著這層關系，樞密院和中書省的配合還算融洽。李吉甫能夠在關鍵時刻力挺自己，崔群也是很感激，多次去平泉別墅探望、感謝他。
心情最為失落的是李絳，他本以為自己才高八斗、能力出眾，又身為右仆射，是右丞的不二人選，結果卻落了空。李絳反思了一番，覺得主要有兩點原因。
一是自己和李吉甫的關系暗地里不合，很多地方政見不同，自己成為朝中少有的與李吉甫不合的官員，這次任命正是在李純探望李吉甫之后，一定是他推薦了崔群，否定了自己。
二是自己有點倔強，不會逢迎，雖說自己有能力，李純也看重，但是在關鍵時刻，李純還是選擇了更能平和處事的崔群，既有點無奈，也有點怨氣。
李藩倒是波瀾不驚，到了樞密院以后，迅速進入角色，熟悉各項事務，認真扮演好秘書長的角色。李藩的能力也是不錯，脾氣性格還算平和，樞密院運作模式他也不去動，蕭規曹隨，對各項事務處理情況，還算讓李純滿意。
中書省新的班子組建后，第一件大事就是商議立太子的事，武元衡和崔群認為，李寧已經去世，太子空缺，應早立太子，以安眾心。
李寧剛走兩個多月，李吉甫因病離職，李純心情很不好，本不想那么早重立太子，但是經不住眾臣的反復請求，就同意讓大臣們先討論此事。
關于冊立太子，眾臣形成了兩種意見。